Евгений Кушнарев был смертельно ранен 16 января 2007 года во время охоты в Изюмском районе Харьковской области. Он получил проникающее огнестрельное ранение в область печени. По сведениям врачей, у Кушнарева были задеты жизненно важные органы. Пострадавшего доставили в реанимацию. На следующий день, 17 января, несмотря на усилия врачей, Евгений Кушнарев скончался.
По официальной версии следствия, непредумышленный выстрел произвел Дмитрий Завальный, помощник-консультант народного депутата Украины Дмитрия Шенцева. Ему было предъявлено обвинение в убийстве по неосторожности. Завальный был без суда амнистирован весной 2009 года, уголовное дело закрыто.
В деле были определенные нестыковки, и семья Кушнарева требует нового расследования.
Евгений Кушнарев был отмечен государственными наградами Украины, иностранных государств, в том числе орден Почетного легиона.
Кушнарев был одним из главных идеологов Партии регионов Украины. Он руководил избирательным штабом партии во время парламентских выборов 2006 года. В свое время Кушнарев занимал должности губернатора Харьковской области и руководителя администрации президента Украины (при Леониде Кучме), а также был одним из лидеров фракции "регионалов" в Верховной Раде.